{"id":187,"date":"2021-10-07T17:39:17","date_gmt":"2021-10-07T15:39:17","guid":{"rendered":"https:\/\/websites.fraunhofer.de\/med2icin\/?p=187"},"modified":"2021-10-07T17:51:31","modified_gmt":"2021-10-07T15:51:31","slug":"towards-an-ontology-representing-characteristics-of-inflammatory-bowel-disease","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/websites.fraunhofer.de\/med2icin\/towards-an-ontology-representing-characteristics-of-inflammatory-bowel-disease\/","title":{"rendered":"Towards an Ontology Representing Characteristics of Inflammatory Bowel Disease"},"content":{"rendered":"\n<p class=\"has-small-font-size\">Khiat, Abderrahmane &amp; Elias, Mirette &amp; Foldenauer, Ann &amp;  Koehm, Michaela &amp; Blumenstein, Irina &amp; Napolitano, Giulio.  (2020). Towards an Ontology Representing Characteristics of Inflammatory  Bowel Disease.  <\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-background has-small-font-size has-very-light-gray-background-color\">Zum gesamten Paper:  <a href=\"https:\/\/www.researchgate.net\/publication\/344543102_Towards_an_Ontology_Representing_Characteristics_of_Inflammatory_Bowel_Disease\">https:\/\/www.researchgate.net\/publication\/344543102_Towards_an_Ontology_Representing_Characteristics_of_Inflammatory_Bowel_Disease<\/a> <br>DOI:<a rel=\"noreferrer noopener\" target=\"_blank\" href=\"http:\/\/dx.doi.org\/10.13140\/RG.2.2.33293.36322\">10.13140\/RG.2.2.33293.36322<\/a><\/p>\n\n\n\n<p>In diesem Artikel\nrealisieren wir das \u201ePatientenmodell\u201c durch die Entwicklung der Inflammatory\nBowel Disease (IBD) Ontologie (d. h. Chronisch-entz\u00fcndliche Darmerkrankungen).\nDie IBD-Ontologie wurde aus anonymisierten Daten von 560 Patienten entwickelt,\ndie von der gastroentologischen Ambulanz im CSV-Format zur Verf\u00fcgung gestellt\nwurden. Die Daten enthalten 170 Parameter pro Patient, darunter Demographie,\nLaborergebnisse und klinische Befunde. Sie wurden entsprechend den\nAnforderungen der Modellierung weiter kuratiert (z. B. Entfernen redundanter\nAttribute, Korrigieren von Ma\u00dfeinheiten). Auf Basis dieser Daten wurde in engem\nAustausch mit den klinischen Experten eine Ontologie als Basis f\u00fcr das\nDatenmodell und den Wissensgraphen entwickelt. Diese Ontologie charakterisiert\ndie chronisch-entz\u00fcndliche Darmerkrankung einschlie\u00dflich diagnostischer\nMethoden, Medikation, Schweregrad, Arztbesuche und anderer Konzepte. Nach der\nErstellung der IBD-Ontologie wurde der Mapping-Prozess implementiert, indem\nOntology-Based DataAccess (OBDA) verwendet wurde, um die Datenquellen dem\nDom\u00e4nenwissen zuzuordnen. In unserem Fall wird die Datenquelle durch die\nCSV-Datei bereitgestellt. Der Mapping-Prozess wird mit Ontop implementiert.\nDieses Modell wird dann verwendet, um \u00c4rzte dabei zu unterst\u00fctzen, die\ntherapeutische Entscheidungsfindung und die Kosteneffizienz deutlich zu\nverbessern.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"850\" height=\"511\" src=\"https:\/\/websites.fraunhofer.de\/med2icin\/wp-content\/uploads\/2021\/10\/Mapping-Approach.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-188\" srcset=\"https:\/\/websites.fraunhofer.de\/med2icin\/wp-content\/uploads\/2021\/10\/Mapping-Approach.png 850w, https:\/\/websites.fraunhofer.de\/med2icin\/wp-content\/uploads\/2021\/10\/Mapping-Approach-400x240.png 400w, https:\/\/websites.fraunhofer.de\/med2icin\/wp-content\/uploads\/2021\/10\/Mapping-Approach-768x462.png 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 850px) 100vw, 850px\" \/><figcaption>Mapping approach<\/figcaption><\/figure>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>In diesem Artikel realisieren wir das \u201ePatientenmodell\u201c durch die Entwicklung der Inflammatory Bowel Disease (IBD) Ontologie (d. h. 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