Dieser Artikel gibt einen Überblick über Projekte im Bereich Digitalisierung und Automatisierung in den Biowissenschaften. Unsere Beiträge wurden in der Hard- und Software sowie in der Prozessentwicklung geleistet. Die Projekte sind chronologisch absteigend geordnet, von derzeit laufenden bis zu abgeschlossenen Projekten.
2021-2022, TEDIAS
Das Verbundprojekt TEDIAS setzt sich zum Ziel, den Prozess der Patientenaufnahme zu digitalisieren und zu automatisieren, indem verfügbare und neuartige medizintechnische Messtechnik mit neuartigen Bedienschnittstellen kombiniert und mit bestehenden Systemen verknüpft werden.
- Laufzeit: April 2021 – Dezember 2022
- Förderung : Land Baden-Württemberg (öffentlich)
- Teilaufgaben:
- Entwicklung eines visuellen Avatars (mit integriertem Chatbotssystem) für die teilweise Automatisierung und Digitalisierung der Anamnese in der Patientenaufnahme
- Referenzen:
2020-2022, ANIMMED
Das Projekt ANIMMED setzt sich zum Ziel, ein Zentrum für angewandte KI-basierte Forschung für die Medizintechnik zu etablieren.
- Laufzeit: September 2020 – September 2021
- Förderung : Land Baden-Württemberg (öffentlich)
- Teilaufgaben:
- Entwicklung eines Chatbotssystem für die digitale Anamnese als Anwendungsfall
- Vernetzung & Präsentation des Projektes
- Bereitstellung und Administration von KI-Hardware (Deep-Learning-Cluster) im Rahmen des Projektes und für Projektpartner
- Referenzen:
2020-heute, EIT Health Transformative Digital Skills for Healthcare
Im Projekt Transformative Digital Skills for Healthcare wurde ein vollumfängliches Bildungs- und Qualifizierungsprogramm für Mitarbeitende im Gesundheitswesen in Zusammenarbeit mit den Universitäten Oxford und Barcelona entwickelt.
- Laufzeit:
- Kurzentwicklung & Prototyp Januar-Dezember 2020
- Kursabgebote: 2021 – heute
- Förderung: EU (öffentlich)
- Teilaufgaben:
- Entwicklung eines vierwöchigen Kurses „Security of Digitized Systems in Healthcare“ (aka Cybersecurity)
- Durchführung des Kurses
- Referenzen:
2016-heute, Merlin Process Designer
Entwicklung eines Softwarewerkzeugss für die Dokument, Planung, Optimierung und Analyse diskreter biotechnologischer Prozesse.
- Förderung: öffentlich/privat (Industrie)
- Links
2015-heute, Beratung in der Laborautomatisierung
Akquisition, Vorbereitung, Durchführung und Nachbereitung verschiedener Workshops zur Planung und Optimierung biotechnologischer Prozesse für verschiedene Kunden.
- Laufzeit : 2015-heute
- Förderung : privatwirtschaftlich (Industrie)
- Referenzen: (nicht öffentlich)
2015-heute, LabFreezer
Dieses Projekt befasst sich mit der Entwicklung eines Tischgerätes zum schnellen Einfrieren und Erwärmen von flüssiger Substanzen in Standard-Multi-Well-Platten für Screeningzwecke.
Wir entwickelten die Gerätesteuerung und die grafische Bedienschnittstelle.
- Laufzeit : 2015-heute
- Förderung : öffentlich / privat (Industrie)
- Referenzen:
Abgeschlossene Projects
Die folgende Projekte wurden abgeschlossen.
2018-2020, Lab-IoT
Smarte Anwendungsfälle mit Ansätzen und Technologie der Industrie-4.0 und des Internet-of-Things im Labor. In Kooperation mit KMU am Standort Mannheim und in Zusammenarbeit mit dem Universitätsklinikum Mannheim (UMM).
- Laufzeit: September 2018 – März 2019
- Förderung : Land Baden-Württemberg (Öffentlich)
- Teilaufgaben:
- Koordination
- Agile Entwicklung Prototypen smarter Labor-IoT-Anwendungsfälle
- Referenzen:
- Ausschreibung: https://www.wirtschaft-digital-bw.de/massnahmen/ideenwettbewerb-transferprojekte/
- Projektseite: http://www.lab-iot.de
2017-2019, Lab of the Future (aka “Cloud Lab”)
This project addresses a new market niche: so-called cloud-labs that offer flexible automated services in a centralized fashion.
Our tasks included the integration of cloud-based lab services with clinical data management systems. We conceived concepts on how to map clinical data onto laboratory data and vice versa, as well as how to represent descriptions of workflows/processes and their parameters based on HL7/FHIR und Allotrope ADF forth and back. We developed a working prototype.
- Lifespan: Oktober 2017 – Dezember 2018
- Funding: public (State of Baden-Wuerttemberg)
- References:
- Press Release (German)
- Poster
2016-2019, MAVO LyDIA HD
Das Ziel dieses Projekts ist die Entwicklung eines Hochdurchsatzsystems für die personalisierte gewebebasierte Diagnose von (d.h. am Beispiel von) Lymphknotenkrebs.
Unsere Aufgabe war die Entwicklung einer elektronischen Lösung / eines elektronischen Tools zur Durchführung und Dokumentation aller Laborabläufe. Da wir ein elektronisches Laborjournal nicht neu erfinden wollten (was das Projekt im Wesentlichen erfordert), haben wir ein bestehendes kommerzielles Produkt genutzt und unseren Merlin Process Designer entsprechend angepasst. Wir modellieren im Merlin Process Designer pathologische Prozesse ganzheitliche, die dann automatisch als Workflow-Beschreibungen im elektronischen Laborjournal RSpace generiert werden. Das elektronische Laborjournal RSpace dient als Frontend, mit dem Endanwender Experimente durchführen und dokumentieren können.
- Laufzeit: 10/2016 – 08/2019
- Förderung: öffentlich (Fraunhofer)
- Referenzen:
- C. Broll: Jagd auf die Killer im Körper, Artikel in „weiter vorn 01/2020“, Frühjahr 2020, Seite 50f, Fraunhofer-Gesellschaft
- B. Polzer, M.-W. Werner-Klein, C. Klein: Lydia HD – neue Wege in der Lymphknotendiagnostik bei Krebs, Artikel in „Biotechnologie in Bayern“, 2019, Seiten 30-33
- S. Scheuermann und S. Schöning: „Personalisierte Medizin: Digitalisierte Probenaufarbeitung für die Einzelzellenanalyse“, in „LaborPraxis“, August 2019
- Merlin-Prozess-Designer:
- Vorgänger-Projekte:
- EU-Projekt ManuCyte (s.u.)
- Merlin Bench (Video)
- Multi-Touch Lab Journal (Blog, German)
- Magazinartikel
2015-2020, Tissue Grinder
Entwicklung eines kleinen Tischgerätes für die teilautomatisierte Gewebedissoziation. Wir zeichnen uns für die Entwicklung der Steuersoftware und der Benutzeroberfläche verantwortlich.
Mittlerweile wird das System TissueGrinder durch die Ausgründung FastForward Discoveries weiterentwickelt und auf den Markt gebracht.
- Laufzeit : 2015-2020
- Förderung : öffentlich / privat
- Referenzen:
- Pressemeldung
- Webseite der Ausgründung FastForward: https://fast-forward-discoveries.com/
2015-2017, Bead Trap
Firmware development for a bench-top measurement device utilizing bead technology.
- Funding: public/private
- References
2015-2016, Oak
Development of an augmented-reality workflow clients (AR-client) for the preparation, the conduct, and the documentation of flow-chemistry experiments using modular setups and exploiting Industry 4.0 concepts.
- Funding: private (Industry)
- References (undisclosed)
2014, LabCoder
Development hardware-software support that digitizes the process of blood collection in clinical environments. Our parts were the design and implementation of the user interface as well as the firmware based on ordinary mobile devices, which have been augmented by dedicated measurement hardware.
- Funding: private (Hospital)
- References: (undisclosed)
2014, InnoCyte split.it
Development of embedded device control and user interface a stand-alone bench-top cell cultivation system.
- Funding: private (Industry)
- References:
2012-2016, CryoMAT
Development of an system that automates the process of deep-freezing of cell cultures for pharmaceutical applications.
- Funding: private (Industry)
- References: (undisclosed)
2011-2015, SELEX
Development of system that automates the SELEX process as an application of molecular and cell biology.
- Funding: private (Industry)
- References:
2010-2013, ManuCyte
Design and development of a novel electronic lab notebook for sterile laboratory environments based on modern multi-touch hardware.
- Funding : public (EU)
- References
2010-2015, Ribolution
Development of an automated solution of RNA preparation.
- Funding: public (Fraunhofer)
- Reference (undisclosed)
2010-2013, Whole-o-Hand
Development of robotic assistant for closed-loop minimally-invasive laparoscopic surgery. Design and implementation of control software based on the CORBA middleware. Design of the software control layer for two robotic manipulators and 6-DOF input devices. The outcome of this project paved the way for the founding of the Fraunhofer Project Group for Automation in Medicine and Biotechnology PAMB.
- Funding: public (Fraunhofer)
- References
2009-2015, Tissue Factory
Joint collaboration between several Fraunhofer institutes having the goal to build an automated facility for the production of skin models. Our parts were the design and development of device drivers, the process management system, the user interface, the implementation of high-level processes for the overall production system.
- Funding: public (Fraunhofer)
- References
2008-2014, Autranomics
Joint collaboration between several the Fraunhofer society and the Max-Planck society having the goal to build an automated system for the reproduction and selection of trans-genomic cell cultures for research purposes. Our parts were the design and development of device drivers, the process management system, the user interface, the implementation of high-level processes for the overall production system.
- Funding: public
- References: