Publications

This page lists various kinds of publications we published so far. The lists are given in descending order of appearance.

Journal Articles

• F. Hanser, S. Schöning, and G. Alford, User research in pharma R & D: Contextual inquiry for the elicitation of user needs in a chemistry laboratory for analytical method development within a corporate continuous manufacturing organization, J. Bus. Chem., vol. 2020, no. 2, 2020.
• U. Thiel, S. Knoch, S. Schöning, and J. Stallkamp, Modellierung und Ausführung klinischer Prozesse in der molekularen Intervention Problemstellung Material und Methoden, CURAC 2018, pp. 100–105, 2018.
• S. Schöning, O. Oesterle, and F. Arends, Entwicklung berührungsloser Interaktionssysteme für die roboterassistierte minimalinvasive Chirurgie, CURAC 2018, 2018.
• A. Rothfuss, O. Oesterle, D. Bürgy, C. Nwankwo, F. Schneider, A. van Poelgeest, F. Wenz, J. Stallkamp, and S. Clausen, System and path planning algorithm for low-kV X-ray free-form surface irradiation, Int. J. Med. Robot. Comput. Assist. Surg., vol. 14, no. 3, pp. 1–10, 2018.
• M. Patel, K. Mankodiya, S. Schoening, A. Opp, A. Domnich, and U. G. Hofmann, A Novel Approach to Measure Optical Density in a Hand-held Pipette, 2010.

Magazine Articles

• S. Schöning: Gold findet, wer tief gräbt – Mining automatisierter Prozesse in den Biowissenschaften, Wiley Analytical Science, May 2021. [Online]
• S. Scheuermann und S. Schöning, Personalisierte Medizin: Digitalisierte Probenaufarbeitung für die Einzelzellenanalyse, LaborPraxis, August 2019. [Online]
• S. Schöning, F. Arends, O. Oesterle: Entwicklung berührungsloser Interaktionssysteme für die roboterassistierte minimalinvasive Chirurgie, wümek 2017, 2017
• S. Schöning, U. Thiel: Ganzheitliche Digitalisierung klinischer Prozesse im Forschungscampus M²OLIE, wümek 2017, 2017
• A. Domnich, I. Poser, S. Schöning, et al., Autranomics – Automated Transgenomics, TechnoPharm, 2015
• F. Maugg and S. Schöning, MErLiN – A novel multi-touch-based assistance system for bio-technological laboratories, 2013.
• E-Health-Com News, Biomedizin: Fraunhofer IPA entwickelt Zaubertisch für das Bio-Labor ehealth.com, 2013.
• V. Fischbein, J. Röhm, and Sebastian Schöning, Multitouch Lab Journal, GIT Fachzeitschrift + GIT Laborportal, 2011. [Online]
• S. Knoch, S. Schöning, M. Bengel, and N. Blümlein, Minifabrik für Kleinteilemontage, wt Werkstattstechnik online, vol. 100, no. 3, pp. 152–155, 2010.
• A. Domnich, S. Schöning, D. Bottländer, and J. Brix, Modulare, intelligente Pipette optimiert die Laborarbeit, Mediendienst, Fraunhofer IPA, 2010.
• A. Domnich, S. Schöning, D. Bottländer, and J. Brix, Advancing the Design of Pipettes, in LabAutomation 2010, 2010.
• A. Domnich, S. Schöning, and D. Bottländer, Konkurrenz fürs Laborbuch, Nachrichten aus der Chemie, 2010.
• S. Knoch, S. Schöning, The Hybrid Lab, in LabAutomation 2010, 2010.
• S. Knoch, S. Schöning, and K. Sandra, Schöne neue (Labor-)Welt, Fraunhofer IPA Interaktiv, 2009.
• S. Knoch, S. Schöning: The Hybrid Lab—Uniting Manual Workplaces, Automation, Logistics, and Information Technology for the Laboratory of the Future in BIOforum Europe 8-9/2009

Selected Talks

• S. Schöning, O. Oesterle, F. Vuthaj, B. Wängler, M. Pretze, A. Marx, C.-A. Weis, “Lab-IoT – Anwendungen des Internet-of-Things in klinischen Laboren”, 4.-th Image-guided Interventions Conference (IGIC), Mannheim, 2019
• S. Schöning, S. Scheuermann, “Automatisierung und Digitalisierung einzelzellbasierter, molekularer Verfahren der Diagnostik von Lymphknotenkrebs”, 4.-th Image-guided Interventions Conference (IGIC), Mannheim, 2019
• S. Schöning, Informationssysteme in den Biowissenschaften: Forschung und Anwendung, keynote Meet&Match event, Bio-Pro (http://www.bio-pro/artikel/10349), 09/2016
• S. Schöning, F. Maugg, Merlin – The digital lab notebook, Max-Planck Digital Library workshop on electronic lab notebooks, Berlin, 03/2016
• S. Schöning, Bridging the Data Handling Gap Between Manual Work Environments, Automated Systems, and High-Level Information Systems, Big Data in Pharma and Laboratory Informatics Summit, Brussels, 09/2015
• S. Schöning: The Projekt Ribolution: SiLA-driven Automation of ncRNA Sample Preparation, keynote presentation at the SiLA conference, MipTec 09/2012, Basel (Switzerland)
• S. Schöning: Modern User Interface Concepts for the Laboratory, presentation at the SiLA conference as part of the special interest group for informatics, MipTec 09/2012, Basel (Switzerland)
• S. Schöning: The urging need for standardization in scientific laboratory automation, keynote presentation at SiLA conference, MipTec 2011, Basel (Switzerland), 09/2011

Posters

• S. Schöning, V. Casteñano-Fresen, P. Kulkarni, Automatic Translation of Workflow Descriptions into Formal Process Notations, 2019 SLAS AI in Process Automation Symposium, Boston, 10/2019, to be presented
• S. Schöning, F. Vuthaj, O. Oesterle, V. Stachel, Utilizing the Allotrope Framework for Dataflows Bridging Clinic and Laboratory, Allotrope Connect Workshop, Vélizy, April 2019
• C. Klein, Fraunhofer ITEM-R, Fraunhofer IPA-PAMB, and Fraunhofer IIS, “Hochdurchsatz-Diagnostiksystem für die gewebebasierte personalisierte Krebstherapie am Beispiel von Lymphknoten”, 2018
• S. Knoch, “M²PROCIT : Eine Prozessmanagementplattform für den MIP Nächste Schritte und Verwertung”, 2018
• O. Oesterle, “M²INT : OR Device Middleware Nächste Schritte und Verwertung”, 2018
• S. Scheuermann and C. Reis, “TissueGrinder Enabling automated , enzyme-free tissue dissociation for personalized medicine”, 2018
• Fraunhofer IPA-PAMB, “BIO Merlin”, BIO 2015, 2015
• S. Schöning, “Entwicklung einer Prozessmanagementplattform für die dynamischen Prozesse in der molekularen Intervention”, 2014
• S. Schöning and L. Poliwoda, “IT – Framework zur OP – Vernetzung für die assistierte minimalinvasive molekulare Intervention”, 2014
• F. Maugg, “MErLiN : A multi-touch based hybrid workplace for medical laboratories”, BGER Symposium 2013. 2013.
• S. Schöning, S. Knoch: The Automation Control System behind the Tissue factory, published as poster for SLAS 2012, San Diego (USA), 2012
• S. Schöning, S. Knoch, S. Gommer: MErLiN—A Novel Electronic Lab Notebook based on Modern Multi-Touch Technology, published as poster for SLAS 2012, San Diego (USA), 2012
• S. Schöning, “Ribolution – Innovative Ribonucleic acid-based Diagnostic Solutions for Personalized Medicine”, 2011.
• S. Knoch, S. Schöning: The Hybrid Lab—Uniting Manual Workplaces, Automation, Logistics, and Information Technology for the Laboratory of the Future, poster presented at the LabAutomation 2010 conference, Palm Springs (USA), 2010
• A. Domnich, S. Schöning, D. Bottländer, J. Brix: Lab-in-a-Pipette—Advancing the Design of Pipettes, poster presented at the conference LabAutomation 2010, Palm Springs (USA)
• Diehl Aerospace, EADS, ETA, eurocopter, and Fraunhofer IPA, “ETZSI – SmartNet, Vorintegration Test ‐ RIG”, 2009

Mentored Theses

• Hofenbitzer, J. ‘Form2Bot’: A pipeline to automate the generation of conversational assistants from medical questionnaires, University of Konstanz, 2023.
• F. Paulus, Business-Case-Analyse der geplanten Digitalisierung mit Hilfe von Internet-of-Things in den Biowissenschaften, Master’s Thesis University of Applied Sciences Darmstadt, 2020.
• P. Kulkarni, Intelligent Editor for Life Science Workflows, Master’s Thesis, Technical University Kaiserslautern, 2019.
• A. Morgan dos Santos, „Praktikumsbericht, Laboratory – Internet of Things“, Internship Report, University of Applied Sciences Mannheim, 2019.
• N. Brenner Miguel, Konzept und Umsetzung der Web-API-Konversion zwischen Prozessplanung und elektronischem Laborbuch, Bachelor’s Thesis, University of Applied Sciences Mannheim, August 2019.
• A. D. Itembe II, Untersuchung des bildgebenden Rezidivs von Glioblastomen durch Machine-Learning-gestützte Automatisierung nach chirurgischer Resektion, Master’s Thesis, Technical University Dortmund, August 2019
• M. Cöllen, Konzept und Umsetzung einer Web-API-Konversion zwischen Prozessplanung und Online-Übersetzungsdienst, Bachelor’s Thesis, University of Applied Sciences Mannheim , June 2019
• A. Almasi, Model-based Planning of Discrete Life-Science Processes, Master’s Thesis, University of Applied Sciences Mannheim, April 2019.
• N. Brenner Miguel, Bericht zum praktischen Studiensemester, University of Applied Sciences Mannheim, Februar 2019.
• P. Mayer, Inverse Radiation Treatment Planning for Robot Assisted, Iod-Seed-Based, Extraprostatic Brachytherapy Carried, 2018.
• L. Harzenetter, Untersuchung des Einsatzes von Holografie in biotechnologischen und medizinischen Laboren anhand eines Demonstrators (Projektarbeit), University of Applied Sciences Hof, 2016.
• K. Ziegler, Entwicklung einer generischen Skript-Ebene für die flexible Automatisierung biotechnologischer Prozesse, University of Applied Sciences Mannheim, 2016.
• E. C. Tchiejie Djialeu, Konzipierung und Implementierung einer Software zur Realisierung einer flexibel konfigurierbaren DICOM-Kommunikation, University of Applied Sciences Mannheim, 2015.
• D. Brecht, Entwurf eines verteilten Echtzeitsystems für die minimalinvasive assistierte Intervention, University of Applied Sciences Mannheim, 2014.
• A. Kaltschmidt, Softwareentwicklung Automatisierung molekularbiologischer Probenvorbereitung, University of Applied Sciences Mannheim, Faculty of Information Technology, 2014.
• S. Hegenbart, Assisting Workbench Manipulator Simulation of ManuCyte scenarios in OpenRAVE, University of Applied Sciences Mannheim, 2012.
• M. Özgü, Entwicklung eines universellen Kommunikationsprotokolls für Embedded Systems, 2012.
• V. Fischbein and J. Röhm, Multitouch Lab Journal, Hochschule der Medien, University Stuttgart, 2011.
• S. Gommer, Mobile Lab Notebook – Konzeption und Realisierung eines elektronischen Laborbuchs für mobile, multitouchfähige Endgeräte im Bereich biochemischer Forschung, 2011.
• F. Knoefel, Entwicklung und Erweiterung von Softwaremodulen für das Projekt ‘Whole-O-Hand’, Fraunhofer IPA, 2011.
• R. Mangler, Erstellung und Usability-Testing eines Prototypen für die Benutzungsschnittstelle der Autranomics-Anlage zur automatisierten Zellzüchtung, 2011.
• Y. Pfalzgraf, User Interface Prototyping und Evaluation eines elektronischen Laborbuches auf der Basis eines Multitouch Systems für die biochemischen Forschung, Hochschule der Medien Stuttgart, 2011.
• N. Schwichtenberg, MErLiN Entwicklung eines elektronischen Laborbuches auf Basis eines Multitouchtisches, Albstadt-Sigmaringen University, 2011.
• M. D. Ita-Bautista, Konzepterstellung einer gebrauchstauglichen Benutzungsschnittstelle zur Steuerung einer Maschine für das Tissue-Engineering, 2010.
• W. El Hakimi, Weiterentwicklung einer Softwaresteuerung für ein roboterbasiertes , zweiarmiges Instrumentenführungssystem für die minimalinvasive Chirurgie, 2010.
• M. Mark, Aufbau und Programmierung eines Mikrocontroller geregelten Service Roboters für die Laborautomatisierung, 2010.
• S. Sinan, Softwareentwicklung für eine intelligente Pipette, 2010.
• S. Voitk, Entwurf und Realisierung einer mikrocontrollerbasierten Steuerung für automatisierte Pipetten, 2010.